结构化学应用是一种在化学研究和实践中广泛使用的方法和理论体系，通过对分子结构进行分析和描述，揭示了分子之间的相互作用规律以及性质与功能之间的关系。结构化学应用可以帮助研究人员设计新的化合物、优化反应条件、预测物质的性质和活性，以及解释实验现象。

应用软件是使用计算机和信息技术来实现特定功能和任务的软件程序。在结构化学领域，有许多应用软件被开发出来，用于处理和分析化学结构数据。

应用软件的概要通常包括以下几个方面：

1. 分子建模和设计：提供分子三维结构的建模和优化功能，可以帮助研究人员设计新的化合物或修改已有化合物的结构。

2. 数据库管理：管理和检索化学结构数据和相关信息，可以提供快速的结构搜索和数据查询功能。

3. 分析与预测：通过对分子结构进行计算和模拟，可以预测物质的性质、反应活性、药效等，并提供数据分析、图形展示等功能。

4. 反应模拟和优化：模拟和优化化学反应的过程、路径和条件，以获得最佳的反应结果。

5. 谱学分析：用于处理和解析质谱、红外光谱、核磁共振等数据，可以快速识别和表征化合物结构。

6. 药物设计和筛选：通过对分子进行分析和计算，预测分子与靶点之间的相互作用，用于新药的设计和筛选。

应用软件的特色通常包括：

1. 用户友好的界面和操作：提供直观的图形化界面和简单易用的操作方式，方便用户进行各种操作。

2. 大规模分子处理能力：支持处理大规模化学结构数据的能力，满足大规模研究的需求。

3. 高效的算法和计算能力：采用高效的算法和计算方法，加速计算过程，提高计算准确性和效率。

4. 数据库和资源的整合：整合不同的化学数据库和资源，方便用户查询和获取相关信息。

5. 结果可视化和分析：提供丰富的结果可视化和数据分析功能，方便用户理解和解释计算结果。

应用软件的机能包括：

1. 分子编辑和建模：提供分子编辑和建模功能，包括原子和键的添加删除、构建分子三维结构等。

2. 分子力场计算和优化：采用分子力场对分子进行能量计算和结构优化，获得最稳定和能量最低的分子结构。

3. 分子动力学模拟：通过分子动力学模拟揭示分子的运动和相互作用规律，预测物质的力学和热学性质。

4. 能带计算和电子结构分析：通过计算分子的能带结构和电子结构，预测材料的导电性和光学性质。

5. 反应性计算和反应路径搜索：通过反应性计算和反应路径搜索，预测化学反应的机理和路径。

6. 谱学数据处理和解析：用于处理和解析质谱、红外光谱、核磁共振等谱学数据，识别和表征化合物结构。